チェックポイント制だがその間隔が長く、やり直しとなるとかなりの長さを繰り返さないとならないケースが発生する。難所を繰り返しプレイしないとならないのは仕方が無いとしても、その場所だけではなくて更に前のパートに到るまで戻らないとならないのは大きな欠点。何回やろうが一緒で簡単に勝てる様なエリアまで繰り返さないとならないのは苦痛でしかない。更には途中にムービーが挟まっているとそれが飛ばせないとなっている。
これと関連して数ヶ所ではあるが難所が存在し、他と比較して飛躍的に難易度が高くなっているのはバランス的に疑問を感じさせる（一応このゲームでは難易度を変更可能なので大きな問題にはなっていないが）。逆にボス格の敵は手応えがなくてこちらは拍子抜けの感有り。
序盤の部隊行動のパートが弱い。所持武器が少ないので攻撃方法に変化が無いというのが一つ。敵のミュータントの攻撃が単純。何より味方兵士で無敵に設定されている者が非常に強い為に、プレイヤーがあまり攻撃しなくてもクリア出来てしまうというケースが増えている。HealthやAmmoも異常と言える位に転がっているので、総合的に簡単過ぎて緊張感が感じられなくなっている。
敵の種類が少ないのは問題点。またエリアによって出て来る種類が異なるので、より同時に登場するタイプは少なくなっている。
ミュータントに変化して攻撃可能な点は良いのだが、その状態での攻撃種類が少なく折角の特徴を活かせていない。Contagion Attackは使い物にならないのでParasite Attackのみに頼る形になってしまっている。通常武器が少ないだけに、もっと変化に富んだ攻撃方法や能力を用意すべきだったと感じる。
これは個人的な環境が影響しているのかもしれないが、マウス感度に細かい補正機能が無く、動きが変に感じられる事が多々有った。
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